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丁彦蕊 性别:女 出生日期:1976.12 职称、职务:教授 电话(手机):18961727448 E-mail:yr_ding@jiangnan.edu.cn |
【学术简介】
博士,教授,硕士生导师,纽约大学访问学者,江苏省生物医学工程学会生物信息学专委会委员。主要科研兴趣是智能计算与复杂网络、生物信息学。发表SCI论文30余篇,申请/授权发明专利及软件著作权共40多项。承担国家自然科学基金、“863”重点项目子课题、教育部“留学回国人员科研启动基金”等6项;参与科技部“重大仪器专项”、“863”项目等5项。获得教育部“高等学校科学研究优秀成果奖”二等奖及“中国石油和化学工业联合会科学技术奖”一等奖。主持太阳集团欢迎您本科教育教学改革研究项目1项。
【工作及研究经历】:
2005.6-2010.5 太阳集团欢迎您信息学院
2010.6-2014.3 太阳集团欢迎您物联网工程学院
2012.3-2013.3 纽约大学访问学者
2014.4-2019.9 太阳集团欢迎您数字媒体学院
2019.10-至今 太阳集团0638
【研究领域】
智能计算与复杂网络、生物信息学
【主要论著】(部分)
主要论文:
[1] 陶斯涵,丁彦蕊*. 引入序列信息的残基相互作用网络比对算法. 软件学报, 2019, 30(11): 3413-3426.
[2] Chen Zhang, Yanrui Ding*. Probing the Relation Between Community Evolution in Dynamic Residue Interaction Network and Xylanase Thermostability. IEEE ACM transactions on computational biology and bioinformatics, DOI 10.1109/TCBB.2019.2922906.
[3] Jie Wang, Yanrui Ding*, Yanyan Wu, Xiaxia Wang. Identification of the complex regulatory relationships related to gastric cancer from lncRNA‐miRNA‐mRNA network. Journal of cellular biochemistry, 2019, 1-12.
[4] Qian Xia, Yanrui Ding*. Thermostability of Lipase A and Dynamic Communication Based on Residue Interaction Network, Protein & peptide letters, 2019, 26(9): 702-716.
[5] Leiyu Zhang, Yanrui Ding*. The relation between lipase thermostability and dynamics of hydrogen bond and hydrogen bond network based on long time MD simulation. Protein & peptide letters, 2017, 24(7): 643-648.
[6] Xiaomei Gao, Yanrui Ding*. Using the residue interaction network improves the classification of thermophilic and mesophilic proteins. Current bioinformatics, 2017, 12(3): 249-257.
[7] Yanrui Ding*, Xueqin Wang, Zhaolin Mou. Effect of Hubs in Amino Acid Network on Iron Superoxide Dismutase Thermostability. Current bioinformatics, 2015, 10(2): 232-239.
[8] Yanrui Ding*, Xueqin Wang, Zhaolin Mou. Communities in the Iron Superoxide Dismutase Amino Acid Network. Journal of Theoretical Biology, 2015, 367: 278-285.
[9] Yanrui Ding*, Yujie Cai, Peidong Sun, Bei Chen. The Use of Combined Neural Networks and Genetic Algorithms for Prediction of River Water Quality. The Journal of Applied Research and Technology, 2014, 12(3): 493-499.
[10] Zhaolin Mou, Yanrui Ding*, Xueqin Wang, Yujie Cai. Comparison of protein-water interactions in psychrophilic, mesophilic, and thermophilic Fe-SOD. Protein & Peptide Letters, 2014, 21: 578-583.
【科研、教学项目】
科研项目:
1. 国家自然科学基金,多模态医学成像引导精准放疗中的快速知识协同与跨域知识借鉴学习方法研究及验证,2018.1-2022.12,64万,排名第2.
2. 国家自然科学基金,基于复杂网络理论的水合作用下Fe-SOD酶热稳定性的关键影响因素研究,2016.1-2016.12,10万,排名第1.
3. 科技部国家重大科学仪器设备开发专项项目,连续分离型超临界流体色谱仪的智能控制系统设计与优化,2013.12-2017.11,150万,排名第2.
4. 留学回国人员科研启动基金,木聚糖酶热稳定性的关键因素研究,2014.9-2015.9,3万,排名第1.
5. 国家自然科学基金,铁超氧化物歧化酶热稳定性的关键因素研究,2011.1-2013.12,20万,排名第1.
6. 江苏省环境检测科研基金项目,太湖入湖河流监测与污染状况预警系统研究,2010年,7万,排名第1.
7. 国家高技术研究发展计划“863”项目,三羟基丙酸生物制造的关键技术研究,2009.1-2011.12,175万,排名第2.
8. 国家高技术研究发展计划“863”重点项目,L-缬氨酸高效清洁发酵生产关键技术的研究,2007.6-2010.5,285万,排名第4.
教学项目:
1. 太阳集团欢迎您研究生教育教学改革研究与实践课题,“双一流”学科建设引领的交叉创新型研究生培养模式的探索,2019年,排名第1.
2. 太阳集团欢迎您本科教育教学改革研究项目,数字媒体技术人才培养驱动的程序设计类基础课程群的改革与实践,2017年,排名第1.
【科研、教学成果及获奖】
科研获奖:
1. 2017年获中国轻工业联合会科技进步三等奖,排名第3.
2. 2014年获中国石油和化学工业联合会科学技术奖二等奖,排名第3.
3. 2012年获教育部高等学校科学研究优秀成果奖(科学技术)二等奖,排名第2.
4. 2012年获中国商业联合会科学技术奖一等奖,排名第3.
5. 2012年获中国石油和化学工业联合会科学技术奖一等奖,排名第2.
教学获奖:
1. 2011年获得太阳集团欢迎您教学成果奖二等奖,排名第2.
【荣誉与奖励】
获得第七届“太阳集团欢迎您我最喜爱的老师”称号。
【在读硕、博士人数】
硕士 14人
【已毕业硕、博士人数】
硕士 16人
【以上资料更新日期】
2019年12月