【学术简介】
博士，教授，博导。太阳集团0638副院长，应用数学系教师，中国交叉科学学会常务理事，中国运筹学会计算系统生物学分会理事，中国工业与应用数学学会数学生命科学专委会理事，江苏省数学学会理事，江苏省概率统计学会常务理事，江苏省生物医学工程学会生物信息学专委会委员，无锡市现场统计研究会理事长，《Briefings in Bioinformatics》《Journal of Molecular Cell Biology》《BMC Genomics》等多家国内外杂志审稿人。多年来一直从事概率统计、随机过程、试验设计与数据处理、生物信息学、数学建模等应用数学的教学和研究工作，已在《Briefings in Bioinformatics》等国际国内学术刊物上发表高水平学术论文50多篇，出版学术专著1部、教材2部，授权发明专利1项。主持在研国家自然科学基金面上项目1项、重点项目课题1项，主持完成国家自然科学基金重大研究计划集成项目课题1项、教育部基本科研面上项目1项、太阳集团欢迎您自然科学基金项目2项、横向项目4项，作为主要参与人完成国家自然科学基金面上项目2项。获中国轻工业联合会科学技术三等奖、中国商业联合会科学技术三等奖、无锡市自然科学优秀学术论文一等奖各1项。主持完成1项省级研究生教改项目、3项校教改项目。获全国素质教育教研成果一等奖1项，校教学成果一等奖2项、二等奖1项。
【工作及研究经历】：
1994.8至今，太阳集团0638工作；
2013.9-2016.6，中科院上海生命科学院系统生物学重点实验室，博士后。
【研究领域】
计算系统生物学，生物信息学，生物统计学等
【主要论著】（著作和论文）
主要论文：
[1] Yujie Wang, Gang Zhou, Tianhao Guan, Yan Wang, Chenxu Xuan, Tao Ding and Jie Gao*. A network-based matrix factorization framework for ceRNA co-modules recognition of cancer genomic data. Briefings in Bioinformatics, 2022. doi: 10.1093/bib/bbac154.
[2] Yan Wang, Jie Gao*, Chenxu Xuan, Tianhao Guan, Gang Zhou, Yujie Wang, Tao Ding. FSCAM: CAM-based feature selection for clustering scRNA-seq. Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2022,, doi: 10.1007/s12539-021-00495-8.
[3] Yujie Wang, Tianhao Guan, Gang Zhou, Hongqian Zhao and Jie Gao*. SOJNMF: Identifying multidimensional molecular regulatory modules by sparse orthogonality-regularized joint non-negative matrix factorization algorithm. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2021, doi:10.1109/TCBB.2021.3114146.
[4] Yichen Sun, Hongqian Zhao, Gang Zhou, Tianhao Guan, Yujie Wang, and Jie Gao*. Random distributed logistic regression framework for predicting potential lncRNA‒disease association. Journal of Molecular Cell Biology, 2021, 13(5): 386-388.
[5] Hongqian Zhao, Jie Gao*, Yichen Sun, Yujie Wang, Tianhao Guan and Gang Zhou. Identifying critical states of Hepatocellular Carcinoma based on single sample dynamic network biomarkers combined with simulated annealing algorithm. Current Bioinformatics, 2021, 16(10): 1288-1298.
[6] Min Wu, Junhua Xu, Tao Ding , Jie Gao*. Mixed distribution models based on single cell RNA sequencing data. Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2021, 13 (3): 362-370.
[7] Yichen Sun, Hongqian Zhao, Min Wu, Junhua Xu, Shanshan Zhu, Jie Gao*. Identifying critical states of hepatocellular carcinoma based on landscape dynamic network biomarkers, Computational Biology and Chemistry, 2020, 85: 107202.
[8] Tao Ding, Jie Gao*, Shanshan Zhu, Junhua Xu, Min Wu. Predicting microRNA-disease association based on microRNA structural and functional similarity network, Quantitative Biology, 2019, 7(2): 138-146.
[9] Junhua Xu, Min Wu, Shanshan Zhu, Jinzhi Lei, Jie Gao*. Detecting the stable point of therapeutic effect of chronic myeloid leukemia based on dynamic network biomarkers, BMC Bioinformatics, 2019, 20(s7):73-81.
[10] Tao Ding, Junhua Xu, Mengmeng Sun, Shanshan Zhu, Jie Gao*. Predicting microRNA biological functions based on genes discriminant analysis, Computational Biology and Chemistry, 2017, 71(12): 230-235.
[11] Jie Gao*, Kang Wang, Tao Ding, Shanshan Zhu, Forecasting influenza A pandemic outbreak using protein dynamical network biomarkers, BMC Systems Biology, 2017, 11(S4): 113-119.
[12] Gao Jie*, Zhang Ling and Jin Peixuan, Influenza pandemic early warning research on HA/NA protein sequences, Current Bioinformatics, 2014, 9(3), 228-233.
[13] Liu Juan and Gao Jie*, Long-memory ARFIMA model for DNA sequences of influenza A virus, Acta Physica Sinica, 2011, 4(60), 048702-6.
[14] Ren Di, Gao Jie*, Early-warning signals for an outbreak of the influenza pandemic, Chinese Physics B, 2011, 20(12), 370-376.
[15] Gao Jie*, Jiang Lili and Xu Zhenyuan, Approximating Long-memory DNA Sequences by Short- memory Process, Physica A, 2009, 388(17), 3475-3485.
[16] Gao Jie*, Jiang Lili and Xu Zhenyuan, Chaos game representation walk model for the protein sequences, Chinese Physics B, 2009, 18(10), 4571-4579.
[17] Gao Jie* and Xu zhenyuan, Chaos game representation (CGR)-walk model for DNA sequences, Chinese Physics B, 2009, 18(1), 370-376.
主要著作：
[1] 高洁著，基于时间序列理论方法的生物序列特征分析，金琅学术出版社，2016.
[2] 曹菊生，魏国强，方正，高洁编，概率统计与数据处理，苏州大学出版社，2011.
[3] 吴有炜，高洁主编，概率论与数理统计，苏州大学出版社，2004.
【科研、教学项目】
科研项目：
1. 国家自然科学基金面上项目，12271216，单细胞多组学数据分析方法研究及应用，2023/01-2026/12，45万元，主持，在研。
2. 国家自然科学基金重点项目课题，11831015，癌症演变的高维组学数据分析与多尺度随机动力学建模，2019/01-2023/12，50万元，主持，在研。
3. 国家自然科学基金重大研究计划集成项目课题，91730301，干细胞增殖的计算建模及其在癌症演变动力学的应用，2018/01-2019/12，20万元，主持，已结题。
4. 国家自然科学基金面上项目，11271163，P53抑癌基因分子调控机制的数学建模及其算法研究，2013/01-2016/12，68万元，主要参与，已结题。
5. 国家自然科学基金面上项目，71273117，基于消费者偏好的可追溯食品消费政策的多重模拟实验研究，2013/01-2016/12，58万元，主要参与，已结题。
6. 教育部基本科研面上项目，JUSRP21117，人类流感病毒种属和亚型预测的模型分析，2011/01-2012/12，15万元，主持，已结题。
教学项目：
1. “试验设计与数据处理”课程教学改革研究，江苏省研究生教育教学改革研究与实践课题，2万，2014.1-2015.12，主持，已结题。
2. “试验设计与数据处理”课程教学改革研究，太阳集团欢迎您质量工程建设项目，0.5万，2014.1-2015.12，主持，已结题。
3. 金融数学的本科教学研究，太阳集团欢迎您质量工程建设项目，0.2万，2009.1-2010.12，主持，已结题。
4. 《数学建模》精品课程，江苏省精品课程建设项目，2万，2009.1-2010.12，参与，已结题
【科研、教学成果及获奖】
科研获奖：
1. 2018年授权发明专利“一种基于动态网络标志物的甲流疫情早期预警模型”
2. 2017年获中国轻工业联合会科学技术三等奖1项；
3. 2017年获无锡市自然科学优秀学术论文一等奖1项；
4. 2016年获中国商业联合会科学技术三等奖1项；
教学获奖：
1. 2017年获校教学成果一等奖1项；
2. 2017年获全国素质教育教研成果一等奖1项；
3. 2015年获校教学成果二等奖1项；
4. 2009年获校教学成果一等奖1项；
5. 主编的《概率论与数理统计》教材2005年获校优秀教材二等奖1项。
【荣誉与奖励】
(1) 2022年获评无锡市学会系统优秀共产党员；
(2) 2022年获评太阳集团欢迎您优秀学术学位硕士学位论文指导教师；
(3) 2019年获太阳集团欢迎您“荣智权奖教金”；
(4) 2017年获评全国素质教育先进工作者；
(5) 2016年获评院优秀共产党员；
(6) 2006年获评校本科评估工作院先进个人。
【在读硕、博士人数】
硕士7人、博士1人
【已毕业硕、博士人数】
硕士14人
【以上资料更新日期】
2022年10月
